Molecular epidemiology of carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii from southern Brazil / Epidemiologia molecular de Acinetobacter baumannii resistente aos carbapenêmicos provenientes do sul do Brasil / Epidemiología molecular de Acinetobacter baumannii resistente a carbapenem del sur de Brasil

Background and Objectives: carbapenem resistance in Acinetobacter baumannii has reached extremely high levels worldwide, and class D OXA-type carbapenemases are the main associated mechanism. This study aimed to assess the phenotypic and molecular profile of clinical carbapenem-resistant A. baumannii (CRAb) isolates from a southern Brazilian border region. Methods: A. baumannii species was identified by the presence of the blaOXA-51 gene, and the susceptibility profile was determined by broth microdilution. The main carbapenemases were investigated by PCR and the molecular typing was performed by PFGE. Results: during the study, a total of 36 CRAb were recovered, of which 85.7% were from respiratory tract samples from ICU patients. High level resistance to were found in contrast to 100% of susceptibility for polymyxin B. The blaOXA-23 gene was present in 34 isolates and was the only one detected other than blaOXA-51. Molecular typing revealed the presence of four clonal strains, two of them endemic during the period of the study. Conclusion: to the best of our knowledge, our study brings the first data about resistance profile in Acinetobacter in the western border of southern Brazil and make aware of endemic clones of CRAb-producing-OXA-23 in this region of state, contributing for the construction of the national epidemiologic scenario of CRAb.(AU)

Justificativa e Objetivos: a resistência aos carbapenêmicos em Acinetobacter baumannii atingiu níveis extremamente altos em todo o mundo, e as carbapenemases do tipo OXA classe D são o principal mecanismo associado. O objetivo deste estudo foi avaliar o perfil fenotípico e molecular de isolados clínicos de A. baumannii resistentes aos carbapenêmicos (CRAb) de uma região de fronteira do sul do Brasil. Métodos: a espécie A. baumannii foi identificada através da presença do gene blaOXA-51, e o perfil de sensibilidade foi determinado por microdiluição em caldo. As principais carbapenemases foram investigadas por PCR, e a tipagem dos isolados de CRAb foi realizada por PFGE. Resultados: durante o período do estudo, 36 CRAb foram recuperados, dos quais 85,7% foram provenientes de amostras do trato respiratório de pacientes de UTI. Uma elevada resistência a aminoglicosídeos e fluoroquinolonas foi encontrada em contraste com 100% de sensibilidade a polimixina B. O gene blaOXA-23 foi encontrado em 34 isolados e foi o único detectado além do blaOXA-51. A tipagem molecular revelou a presença de quatro linhagens clonais, duas delas endêmicas ao longo do período do estudo. Conclusão: nosso estudo traz os primeiros dados sobre o perfil de resistência em Acinetobacter na fronteira oeste do sul do Brasil e alerta para a presença de clones endêmicos de CRAb produtores de OXA-23 nessa região, contribuindo para a construção do cenário epidemiológico nacional de CRAb.(AU)

Justificación y Objetivos: la resistencia a carbapenémicos en Acinetobacter baumannii ha alcanzado niveles extremadamente altos en todo el mundo y las carbapenemases OXA de clase D son el principal mecanismo asociado. El objetivo de este estudio fue evaluar el perfil fenotípico y molecular de los aislados clínicos de A. baumannii resistentes a carbapenémicos (CRAb) de una región fronteriza en el sur de Brasil. Métodos: la especie A. baumannii se identificó a través de la presencia del gen blaOXA-51 y el perfil de sensibilidad se determinó por microdilución en caldo. Las principales carbapenemasas fueron investigadas por PCR y la tipificación se hizo con PFGE. Resultados: durante el período de estudio, se recuperaron 36 CRAb, 85,7% de muestras del tracto respiratorio de pacientes de la UCI. Se encontró una alta resistencia a los aminoglucósidos y las fluoroquinolonas en contraste con 100% de sensibilidad a polimixina B. El gen blaOXA-23 se encontró en 34 aislamientos y fue el único detectado además de blaOXA-51. La tipificación molecular reveló la presencia de cuatro cepas clonales, dos de ellas endémicas durante el período de estudio. Conclusiones: hasta donde sabemos, nuestro estudio trae los primeros datos sobre el perfil de resistencia en Acinetobacter en la frontera oeste del sur de Brasil y reconoce los clones endémicos de CRAb productores de OXA.(AU)

Prevalência de carbapenemases em enterobactérias resistentes a carbapenêmicos em quatro hospitais terciários de Porto Alegre / Prevalence of carbapenemases in carbapenem-resistant Enterobacteriaceae in four tertiary care hospitals in Porto Alegre

INTRODUÇÃO: A disseminação de Klebsiella pneumoniae carbapenemase (KPC) no Brasil e a recente detecção de bactérias produtoras de New Delhi metalo-β-lactamase (NDM-1) em hospital terciário do sul do Brasil indicam a necessidade da avaliação da presença destas enzimas em enterobactérias resistentes a carbapenêmicos (ERC).OBJETIVO: Avaliar prevalência de carbapenemases nas ERC em quatro hospitais terciários de Porto Alegre, por meio de PCR multiplex em tempo real. MÉTODOS: Estudo descritivo, período de abril a dezembro de 2013. Isolados bacterianos de pacientes internados foram identificados pelo sistema automatizado VITEK 2, com realização do teste de suscetibilidade aos antimicrobianos. Amostras com isolados de ERC foram encaminhadas ao laboratório de referência para análise por PCR em tempo real para identificação de carbapenemases. RESULTADOS: Total de 701 isolados. As ERC predominantes foram K. pneumoniae (47% das amostras positivas) e Enterobacter cloacae (18%). As carbapenemases mais frequentes foram KPC (48%), OXA-48-like (3%) e NDM (2%). Em 47% das amostras não foi identificado o mecanismo de resistência. Isolados originados de culturas de vigilância foram associados com maior positividade para carbapenemases do que isolados de amostras clínicas (p<0,0001). Isolados de ERC pertencentes ao grupo Proteae (Proteus spp., Morganella spp., Providencia spp.) foram associados a menor positividade para carbapenemase do que isolados de outras ERC (p<0,0001). CONCLUSÃO: KPC foi a carbapenemase mais frequentemente detectada. A circulação de uma enzima OXA-48-like foi demonstrada, um achado novo e preocupante. O achado da carbapenemase NDM também é preocupante devido ao seu potencial de disseminação. Esses dados e outros estudos poderão contribuir para um entendimento maior da epidemiologia das ERC.

BACKGROUND: The spread of Klebsiella pneumoniae carbapenemase (KPC) in Brazil and the recent detection of bacteria producing New Delhi metallo-β-lactamase (NDM-1) in a tertiary care hospital in Porto Alegre indicate the need to evaluate the presence of these enzymes in carbapenem-resistant Enterobacteriaceae (CRE). AIM: To evaluate the prevalence of carbapenemases in CRE in four tertiary care hospitals in Porto Alegre using multiplex real-time PCR.METHODS: Descriptive study from April to December 2013. Bacterial isolates from hospitalized patients were identified by VITEK 2 automated system, with antimicrobial susceptibility testing. Samples with CRE isolates were sent to the reference laboratory for analysis using real-time PCR for identification of carbapenemases. RESULTS: Total of 701 isolates. The predominant CRE were K. pneumoniae (46% of positive samples) and Enterobacter cloacae (18%). The most frequent carbapenemases were KPC (48%), OXA-48-like (3%), and NDM-1 (2%). In 47% of the samples no carbapenemase was identified. Isolates originated from surveillance cultures were associated with higher positivity for carbapenemases than isolates from clinical samples (p<0.0001). CRE isolates belonging to the Proteae group (Proteus spp., Morganella spp., Providencia spp.) were associated with less positivity for carbapanemase than isolates of other CRE (p<0.0001). CONCLUSION: KPC was the most frequently detected carbapenemase. The movement of an OXA-48-like enzyme was demonstrated, a novel and worrisome finding. The finding of carbapenemase NDM is also worrisome due to its dissemination potential. These data and further studies may contribute to a better understanding of the epidemiology of CRE.